Futbola Kilimlispor’da başlayan Ergün Penbe 1992-1994 yılları arasında Gençlerbirliği’nde top koşturmuştur. 1994 yılında Galatasaray’a transfer olmuştur.
Gençlerbirliği’nde 1992-1994 yılları arasında 60 resmi karşılaşmada forma giydi ve 4 gol attı. Gençlerbirliği’nde oynadığı ilk maç; 1991-1992 Sezonu 1. Lig 19. Hafta Maçı, Gençlerbirliği 0-0 Altay maçı dır.
Sol bek mevki ve orta sahanın solunda görev yapan oyuncu ince fiziği ve yüksek tekniği ile Galatasaray’da ve A milli takımımızda uzun yıllar görev yapmıştır.
2000 yılında Uefa Finalinde Arsenal’e karşı kullandığı penaltıyı gole çevirip başarıda önemli bir katkısı olmuştur
İlk defa 1994′te Rusya maçıyla milli formayı giymiştir. 48 defa Milli Takım Formasını giymiştir. Türk milli futbol takımının 2002 Dünya kupasında Dünya üçüncülüğünü elde etmesinde katkısı büyüktür.Ergün Penbe, Soğukkanlılığı ve efendiliği ile futbol dünyasında ender futbolculardan biridir.Kariyeri Boyunca sadece 1 defa kırmızıkart görmüştür; o da 1996 yılında Trabzonspor maçında 2 sarı karttan dolayı verilmiştir.
Galatasaraydan sözleşmesi bittiği için 2006-2007 Sezonu Sonunda ayrılmıştır. Kimseye dargın olmadığını söylese de yıllardır hizmet ettiği klübünden böylesine ayrılmak Ergün’ü üzmüştür.